科研平台建设情况
基础医学部科研平台占地面积约1567.74平方米，分为电子显微镜实验室、分子生物学与生化实验室、细胞生物学实验室、组学实验室和微生物实验室、组织病理学实验室、动物学实验室等七大功能实验室。依托基础医学部科研平台获批建立机能与临床转化福建省高校重点实验室、福建省呼吸疾病精准医学协同创新中心两个省厅级实验室，以及厦门医学院呼吸疾病研究所和医学转化中心两个校级实验室。平台利用共享网络管理系统，对校内外开放，通过合作、有偿服务等多种方式，在医学研究的前沿领域提供一系列有特色的关键技术和方法，为开展基础医学及临床医学交叉领域的研究提供良好的技术支撑，促进资源共享，提升医学学科科研水平。
科研平台装备先进，拥有一批高精密的实验仪器和设备，主要设备有透射电镜、扫描电镜、超高分辨率共聚焦显微镜、超高效液相色谱与飞行时间质谱联用仪、分选型流式细胞仪、分析型流式细胞仪、全视野细胞扫描分析系统、数字PCR仪、恒温扩增分析仪、高通量基因测序仪、生命科学分子模拟平台、纳米颗粒跟踪分析仪、小动物活体光学成像系统、手术显微镜、烟雾发生器、塔式口鼻暴露系统、大小鼠心脏灌流系统、离体肺灌流系统、小动物呼吸功能监测系统等，仪器总价值约5896.18万元。
（一） 电子显微镜实验室
由准备室、取材（取样）室、样品包埋室、半薄切片与超薄切片室、染色室、透射电镜室、扫描电镜制样室、扫描电镜室等组成。
Hitachi HT7700 EXALEN透射电子显微镜
生物型透射电镜主要适用于生物医学领域、纳米高分子材料领域等的微观结构研究，通过超薄切片观察动植物与细胞内部超微结构，病毒、纳米药物类等负染色样品观察分析表面超微形态结构，是组织胚胎学、病理学、细胞生物学、生化学、生理学、药理学等重要的研究分析工具。
日立 FlexSEM 1000II扫描电子显微镜
扫描电镜可对生物、医学样品及药物、牙齿等固体材料的内外微观表面进行观察和分析研究，对样品表面形态的二次电子像、反射电子像观察及图像处理，配备的EDS能谱分析系统，还可以对样品微米级定点位置进行元素半定量分析。
（二）分子生物学与生化实验室
分为核酸分子实验室和通用理化实验室，核酸分子实验室配备有恒温扩增分析仪、荧光定量PCR仪、ThermoFisher/QuantStudioTM 3D数字PCR仪、梯度PCR仪、多功能酶标仪、凝胶成像系统、超微量蛋白核酸测定仪等仪器。主要进行核酸扩增、核酸分析、核酸提取、核酸定量和纯度检测、酶联免疫吸附试验等实验。
ThermoFisher/QuantStudioTM 3D数字PCR系统
该仪器可灵敏且精确对核酸进行绝对定量。无需使用任何标准品或标准曲线，无需借助Ct值比较，同时大大提高小概率事件检测能力。可进行测序结果验证、文库构建评估、甲基化研究、基因表达、SNV、MicrioRNA 、表观遗传学研究等。
（三）细胞生物学实验室
由细胞培养室、流式细胞仪室、显微观察室等组成。
（1）细胞培养室内设万级洁净室1间、无菌操作间3间、细胞观察与孵育区1间及准备区1间。配备有生物安全柜、CO2培养箱、倒置研究级荧光显微镜、贝克曼CytoFLEX LX分析型流式细胞仪、细胞计数仪及超高速分选型流式细胞仪（FACSAria Ⅲ/美国BD）、PerkinElmer全视野细胞扫描分析系统等仪器设备。
BD FACSAria Ⅲ超高速分选型流式细胞仪
该仪器配置4根激光器，488nm、635nm、355nm、405 nm，可实现9色荧光11个参数分析，具有多种分选收集装置;可使用5ml收集管、15ml收集管。BD FACSAria 流式细胞分选仪，能对复杂样本中的细胞进行鉴定、分类、定量和分离，单次可同时对其中一种到四种特定细胞进行超高速分选纯化、高通量单克隆分选或细胞芯片制备。分选后的细胞能直接用于培养、移植、核酸提取、单细胞PCR扩增或原位杂交等，可进一步进行细胞基因、蛋白、功能水平的研究和不同细胞之间的差异化的研究。
贝克曼CytoFLEX LX分析型流式细胞仪
该仪器配备5个激光器(UV、NUV、蓝光、绿光、红光)18检测通道，超高的灵敏度和分辨率，分析速度达到 50000个/S，可进行细胞群比测定、表型测定，细胞因子检测、细胞增殖、凋亡、周期等实验。
（2）显微镜室为恒温、恒湿十万级洁净暗室。安装有徕卡TCS SP8 STED超高分辨共聚焦显微镜、illumina MiSeq高通量基因测序仪等设备。
徕卡TCS SP8 STED超高分辨共聚焦显微镜
该仪器配备有405激光器、白激光器（波长范围470-670）和660 STED激光器，配备有10×、20×、63×共聚焦专用油镜及100×STED共聚焦专用油镜，在荧光显微镜成像的基础上加装激光扫描装置，结合数据化图像处理技术，采集组织和细胞内荧光标记图像。STED是目前唯一纯光学实现超高分辨率的显微技术。常规生物样品的xy分辨率可达50nm，z轴分辨率可达130nm，可以在纳米尺度下进行共定位研究和活细胞成像。
illumina MiSeq高通量基因测序仪
该仪器可进行DNA测序、杂合子分析、单链构象多态性分析等；
（四）组学实验室
组学实验室分为质谱实验室和中药及天然产物研究室组成
（1）质谱实验室现配备有超高效液相色谱与飞行时间质谱联用仪和超高效液相色谱仪。
Waters Acquity UPLC H-Class Plus/Xevo G2-XS Tof
超高效液相色谱四极杆飞行时间质谱联用仪
利用离子飞行时间的不同, 精确的判断离子的分子量, 可以用来鉴定复杂样品中的主要成分, 其同时配有一个工作站,软件可以分析质谱取得的大数据以及鉴定未知化合物，可用与找寻疾病的"生物标志物"以及鉴定未知的化合物。
（2）中药及天然产物研究室
中药及天然产物研究室主要进行中药及天然产物提取分离的研究，配备有制备型高效液相仪、冷冻干燥机和旋转蒸发仪等相关仪器。
epacore制备色谱系统由两个5Mpa泵单元、进样单元、制备柱、检测器、自动馏分收集器组成，适用于正相、反相或凝胶系统，广泛应用于中草药、天然产物、海洋产物、有机合成产物、蛋白质生物高分子以及有机污染物的快速分离纯化。
（五）微生物实验室
微生物实验室配备生物安全柜，超净工作台，培养箱，摇床等装置，可进行细菌培养等实验。
（六）组织病理实验室
分为取材室、石蜡包埋切片室、切片染色室和显微观察分析室。
组织病理技术实验室配备了取材台、全自动组织脱水机、包埋机、冰冻切片机、石蜡切片机、摊片机、全自动染色机、原位杂交仪等设备，主要用于组织病理标本冰冻切片、石蜡切片的HE染色、特殊染色、免疫组化、荧光原位杂交等实验，提供各学科的科学研究。
（1）正置荧光全电动显微镜：蔡司Imager Z2型，可对明场及荧光标记切片进行观察，主要用于高清晰显微结构观察与摄影、荧光标记的定位、荧光强度的分析、细胞计数、三维拼接等功能。
（2）数字切片扫描系统与应用系统：麦克奥迪，通过全自动显微镜扫描平台，扫描与控制软件系统，将传统的玻璃切片进行扫描和无缝拼接，生成包括传统玻璃切片内所有信息的全视野的数字化切片。
（3）荧光原位杂交工作站：徕卡，CytoVision 图像分析和摄取系统。可利用特异的DNA/RNA探针，与待检测的染色体或组织切片上细胞内的DNA进行原位杂交，形成靶DNA与核酸探针特异性结合的杂交体，荧光显微镜下对杂交信号进行分析。
（七）实验动物学实验室
分为动物模型制备室、动物影像室、动物手术室和动物饲养室。
（1）动物模型制备室
该实验室配备有手术显微镜、体视显微镜、动物麻醉机、动物呼吸机、大小鼠心脏灌流系统、塔式口鼻暴露系统、小动物全身体积描记系统、小动物呼吸功能监测系统、烟雾发生器等仪器。可开展动物模型的制备、动物器官移植、以及动物的诱咳、引喘等实验。蔡司OPMI Pico手术显微镜是一台用于手术操作的显微镜，操作同时可以显示并记录显微镜提供的图像。
DSI Buxco全身体积描记系统
该仪器简称WBP系统 (Whole Body Plethysmography), 主要用于监测清醒自由活动、非束缚、非麻醉状态下实验动物的呼吸功能。监测过程中，实验动物需放置于特殊设计的腔体中进行实验。WBP 腔体配有高敏感度的压差传感器，可探测腔体内细微的气压变化。
DSI Buxco® PFT系统
该系统适用于临床前肺功能研究，可对麻醉动物进行一系列成组实验的数据自动分析与检测，包括FRC功能残气量检测，FEV、FVC、用力肺活量、准静态肺顺应性、气道阻力以及动态肺顺应性、TLC肺容积、VC肺活量等直接生理指标，与人类肺功能测试得到的指标基本相同。FRC检测要求动物保持自主呼吸状态，其它测试均可在使用呼吸机辅助呼吸或动物自主呼吸状态下进行。实验中动物需中度麻醉，系统全自动进行检测。
DSI Buxco 塔式口鼻暴露系统
该系统由暴露塔、动物束缚器和控制器三部分组成，可实现在曝露的同时进行精准的实时呼吸参数监测。常用动物：小鼠、大鼠、豚鼠、雪貂等。暴露系统适用于多种介质的鼻部暴露式吸入染毒实验以及环境监测等研究，可暴露雾化气溶胶、各种气体、粉尘、烟雾等介质
（2）小动物活体成像室
Lumina XRMS 小动物活体成像仪
小动物活体成像室配备有小动物活体光学成像系统。可进行动物炎症研究、肿瘤研究、感染性疾病研究。Lumina XRMS小动物活体光学成像系统具备最高灵敏度的生物发光、多光谱荧光、放射性同位素和X光活体成像功能，可实现动物生物荧光成像、X光成像、光学及X光融合成像。
实验室联系人：隋华秀
Email：jnylczh@xmmc.edu.cn
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