| 学院发展时期 | 职务 | 领导姓名 | 任职时间 |
| 厦门医学高等专科学校基础部 | 主任 | 王玉孝 | 2006年-2015年 |
| 主任 | 陈素云 | 2015年-2018年 | |
| 厦门医学院 基础医学部 | 书记 | 吴春 | 2024年10月-2024年11月 （2018年-2024年9月期间 为基础医学部党务工作负责人） |
| 主任 | 王玉孝 | 2018年9月-2022年12月 | |
| 王琛 | 2023年6月-2024年11月 | ||
| 副主任 | 伊雪 | 2018年10月-2024年11月 | |
| 武闯 | 2018年5月-2021年2月 | ||
| 田志逢 | 2021年7月-2024年10月 | ||
| 厦门医学院 基础医学院 | 书记 | 吴春 | 2024年11月至2026年6月 |
| 副书记 院长 | 王琛 | 2024年11月至2026年6月 | |
| 书记 院长 | 田志逢 | 2026年7月至今 | |
| 副院长 | 伊雪 | 2024年11月至今 |
