为适应我省医疗卫生事业发展需要，加强校本部与附属医院深度融合，推进资源有效整合，提高学校整体科研能力，日前，我校基础医学部和附属第二医院呼吸病医院联合成立厦门医学院呼吸疾病研究所，柯明耀主任医师担任所长，伊雪教授担任副所长。
研究所主要瞄准严重影响我省人民健康的重大、常见和多发的呼吸系统疾病开展研究，通过综合运用流行病学、医学统计学、分子生物学、蛋白质组学、细胞生物学、病原微生物学、病理学、病理生理学、实验动物学、免疫与变态反应学、呼吸内科学、胸外科学、危重症医学、肿瘤学等众多相关学科的理论与方法，开展多学科交叉合作研究，密切基础与临床研究的结合和相互转化，发现呼吸系统疾病的流行病学特点及影响因素，阐明发病机理和发生发展规律，探索临床诊治防技术及制订诊治防策略。
研究所创立的“临床-基础-临床”研究模式，实现了校院资源共享、优势互补，充分进行学科融合、渗透和交叉，聚集和培养优秀专业人才，缩短从实验室到临床的距离，将基础研究成果快速转化为临床应用，使患者和民众的健康直接地、更快地受益于科技发展，力争将研究所建设成为省内有一定影响力的呼吸疾病创新研究基地、高层次人才培养基地、高水平成果孵化基地，满足学校学科建设及科研水平提升需求。（基础医学部 供稿）
