厦门医学院图书馆实行“藏、借、阅、习”一体化管理模式。图书馆馆舍面积1.5万平方米，阅览座位920个，馆藏总量约为151.6万册，其中纸质图书81.4万册，电子图书70.2万册，现有纸质期刊550种，报纸30种。引进和购置数据库21个，其中中文数据库14个，外文数据库7个。周一至周日全天开放，周开放时长达100小时，电子资源24小时开放。馆内设有：综合图书阅览室、医学图书阅览室、期刊阅览室、研究室、电子阅览室等，其中，电子阅览室拥有120个机座，可向师生提供网络、光盘等电子信息的检索和咨询服务。馆内一卡通集入馆、借书、预约于一体，已实现全开放、大流通、多自助的先进管理模式。为师生提供了最快捷、全方位的信息获取与交流的平台。
馆藏资源建设围绕着学校的专业设置及教学科研需要，以医药卫生类学科书刊为特色。目前，图书馆已基本形成印刷型文献与电子文献并存，实体资源与虚拟资源有机结合，以临床医学、口腔医学、护理学、药学等专业为主，涵盖全校各学科专业，基本满足我校教学和学习需要的藏书体系。
图书馆于2002年3月开始启用图书馆自动化管理集成系统，目前已实现了书刊采访、编目、典藏、流通、书目检索等业务流程的计算机自动化管理，规范化、标准化的馆藏书目数据库也初步建立。局域网经过结构化布线，采用先进的网络设施、服务器，可以与校园网、中国教育网和Internet相联接。同时读者在校园网内可进入图书馆网页进行书目查询、图书续借等自助服务。为提高座位利用率，图书馆于2021年12月正式启用座位预约系统。
图书馆坚持“读者第一，服务育人”的办馆方向，以为教学、临床、科研服务为宗旨，围绕学院总体发展目标，继续加强图书馆自动化、数字化建设。努力建设成为服务主导型的现代化专业性图书馆，以高质量、高效率为学校的教学科研和读者服务。(以上数据截至2026年06月01日）
