厦门医学院附属口腔医院是国内大型公立口腔专科三级医院，总院位于吕岭路1309号，毗邻湖边水库，建筑面积近10000平方米；分院位于思明区斗西路，毗邻中山公园西门，建筑面积5500平方米；设有口腔医学研究所和义齿加工中心。

现有职工总人数422人，其中硕士研究生以上学历119余人，博士9人，中级职称123人，高级职称52人。医院口腔医疗设备先进，拥有进口口腔综合治疗机230台，数字化口腔修复扫描系统9台、意大利NEW Tom VQ口腔颌面锥形束CT机2台、数字化全景X光机2台、fotona牙科双波激光治疗机3台、口腔根管显微镜21台、德国美诺(MEILE PROFESSIONAL)器械消毒清洗系统，以及其他各种进口设备。

附属口腔医院长期以来一直承担着医疗、教学、科研三项中心任务。医院临床诊治能力较高，部分学科为国内领先，多个学科处于福建省领先水平，年门诊量约30余万人次；近三年有25项科研立项，其中国家级项目2项；发表论文87篇，参与专著出版编写7部，获得专利5项，开展省级、国家级继续教育项目5项，其中国家级1项。拥有19位中华口腔专业委员会委员，20多位福建省口腔医学专业委员会委员。口腔医院已逐步成为国内大规模的临床、科研、教学和预防保健的基地。